Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms