Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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COL4A6Q14031 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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COL4A6Q14031 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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COL4A6Q14031 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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COL4A6Q14031 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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COL4A6Q14031 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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