Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APOFQ13790 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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