Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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