Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms