Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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