Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms