Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms