Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC009517.1-201ENST00000454750 570 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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PTPN13Q12923 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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PTPN13Q12923 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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PTPN13Q12923 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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