Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms