Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDR1Q08345 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms