Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 386.6 ms