Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms