Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms