Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RELQ04864 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RELQ04864 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RELQ04864 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RELQ04864 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RELQ04864 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RELQ04864 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RELQ04864 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RELQ04864 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RELQ04864 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RELQ04864 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RELQ04864 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RELQ04864 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RELQ04864 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RELQ04864 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RELQ04864 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RELQ04864 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RELQ04864 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RELQ04864 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RELQ04864 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RELQ04864 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RELQ04864 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RELQ04864 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RELQ04864 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RELQ04864 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RELQ04864 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RELQ04864 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RELQ04864 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 PAX9-202ENST00000402703 3104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RELQ04864 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RELQ04864 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RELQ04864 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RELQ04864 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RELQ04864 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms