Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms