Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms