Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms