Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms