Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms