Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPL23P62829 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPL23P62829 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPL23P62829 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPL23P62829 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPL23P62829 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPL23P62829 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RPL23P62829 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPL23P62829 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPL23P62829 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPL23P62829 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPL23P62829 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPL23P62829 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPL23P62829 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPL23P62829 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms