Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms