Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PIP4K2AP48426 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIP4K2AP48426 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIP4K2AP48426 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms