Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms