Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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