Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP1P32455 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBP1P32455 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBP1P32455 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBP1P32455 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBP1P32455 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBP1P32455 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBP1P32455 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBP1P32455 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBP1P32455 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBP1P32455 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBP1P32455 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBP1P32455 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBP1P32455 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBP1P32455 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBP1P32455 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBP1P32455 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBP1P32455 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBP1P32455 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBP1P32455 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms