Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC8A1P32418 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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