Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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CASQ1P31415 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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CASQ1P31415 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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CASQ1P31415 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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CASQ1P31415 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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CASQ1P31415 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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CASQ1P31415 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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CASQ1P31415 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CASQ1P31415 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CASQ1P31415 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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