Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms