Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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