Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRHP20396 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRHP20396 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRHP20396 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRHP20396 IGHV1OR15-9-201ENST00000338912 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRHP20396 RN7SL452P-201ENST00000482923 291 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRHP20396 RN7SL2-201ENST00000490232 300 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC098591.1-202ENST00000507914 937 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRHP20396 DNM1P50-201ENST00000565767 508 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRHP20396 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRHP20396 RN7SL4P-201ENST00000584058 295 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRHP20396 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC093072.1-201ENST00000589196 602 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRHP20396 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRHP20396 WASH5P-206ENST00000632506 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRHP20396 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRHP20396 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRHP20396 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRHP20396 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRHP20396 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRHP20396 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRHP20396 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRHP20396 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 IGKV2-28-201ENST00000482769 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC009132.1-201ENST00000565194 320 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 RN7SL322P-201ENST00000583519 299 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 MGST3-214ENST00000627653 1130 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRHP20396 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 AL356583.3-201ENST00000412354 417 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC090587.1-201ENST00000415809 494 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 RN7SL47P-201ENST00000488710 299 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC017100.1-201ENST00000565978 1169 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRHP20396 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 ENO3-201ENST00000323997 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 FOLR1-203ENST00000393679 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 TAGLN2-201ENST00000320307 709 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 SERPINB8P1-201ENST00000401898 377 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
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