Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms