Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GOT1P17174 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GOT1P17174 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOT1P17174 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOT1P17174 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOT1P17174 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOT1P17174 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOT1P17174 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOT1P17174 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOT1P17174 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOT1P17174 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOT1P17174 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOT1P17174 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOT1P17174 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOT1P17174 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms