Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2RAP15509 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms