Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 FAM69A-204ENST00000615519 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DMDP11532 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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