Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COX5BP10606 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COX5BP10606 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms