Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms