Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC192P0DO97 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms