Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLA1P09884 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLA1P09884 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLA1P09884 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLA1P09884 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLA1P09884 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLA1P09884 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLA1P09884 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLA1P09884 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLA1P09884 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLA1P09884 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLA1P09884 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLA1P09884 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLA1P09884 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLA1P09884 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLA1P09884 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLA1P09884 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLA1P09884 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLA1P09884 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLA1P09884 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLA1P09884 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLA1P09884 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLA1P09884 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLA1P09884 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLA1P09884 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLA1P09884 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms