Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
F13BP05160 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
F13BP05160 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
F13BP05160 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
F13BP05160 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
F13BP05160 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
F13BP05160 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
F13BP05160 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
F13BP05160 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
F13BP05160 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
F13BP05160 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
F13BP05160 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
F13BP05160 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
F13BP05160 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
F13BP05160 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
F13BP05160 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
F13BP05160 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
F13BP05160 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
F13BP05160 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
F13BP05160 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
F13BP05160 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
F13BP05160 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
F13BP05160 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
F13BP05160 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
F13BP05160 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
F13BP05160 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
F13BP05160 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
F13BP05160 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
F13BP05160 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
F13BP05160 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
F13BP05160 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
F13BP05160 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
F13BP05160 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms