Protein–RNA interactions for Protein: O95197

RTN3, Reticulon-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3O95197 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN3O95197 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RTN3O95197 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RTN3O95197 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RTN3O95197 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RTN3O95197 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RTN3O95197 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN3O95197 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN3O95197 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN3O95197 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN3O95197 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN3O95197 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN3O95197 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN3O95197 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN3O95197 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN3O95197 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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