Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN11O75508 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN11O75508 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN11O75508 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN11O75508 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN11O75508 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN11O75508 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN11O75508 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN11O75508 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CLDN11O75508 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN11O75508 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN11O75508 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CLDN11O75508 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CLDN11O75508 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CLDN11O75508 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CLDN11O75508 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CLDN11O75508 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CLDN11O75508 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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