Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SGTAO43765 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SGTAO43765 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGTAO43765 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SGTAO43765 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SGTAO43765 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SGTAO43765 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SGTAO43765 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SGTAO43765 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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