Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms