Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms