Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms