Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms