Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms