Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms