Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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